Daftar Laboratorium

Biologi Molekular Kesehatan dan Diagnostik

Lab BMKD berdiri pada tahun 2014, dibentuk berdasarkan SK KAPUS P2 Bioteknolologi LIPI NOMOR : 0102/IPH.2/HK.01.03/2011 didukung oleh staf  terdiri dari multidisiplin ilmu meliputi: Rekayasa protein, Biokimia, Biomedik, Bioteknologi , Pangan, Kimia dengan jenjang pendidikan S3 (dua orang), S2 (tiga orang), sedang melanjutkan jenjang S1 (dua orang) dan STM (satu orang). Tugas dan fungsi lab BMKD adalah melakukan studi dan mengembangkan paket sistem deteksi dan diagnostik berupa penyediaan material, formulasi dan teknologi diagnostik sehingga diharapkan akan meningkatkan kemandirian bangsa Indonesia dalam hal kit deteksi dan diagnostik. Hingga 2017, sumber pendanaan yang telah diterima berasal dari dana APBN LIPI maupun dari luar LIPI yang meliputi: KOMPETITIF LIPI, KEGIATAN UNGGULAN LIPI, DIPA TEMATIK, PUSINOV LIPI, INSINAS RISTEK.  Tema penelitian yang telah dikerjakan adalah penyediaan protein untuk aplikasi biosensor (Cellobiose Dehidrogenase), teknologi deteksi mutasi dan SNP berbasis PCR untuk diterapkan pada kanker payudara, paru dan serviks, studi skoring HER-2 berbasis qPCR.

Dari kegiatan penelitian yang sudah dilakukan dihasilkan tiga buah paten, empat prototipe kit deteksi dan diagnostik, karya tulis  nasional dan internasional serta laporan PKL, skripsi dan thesis dari beberapa perguruan tinggi terkemuka di Indonesia. Salah satu dari invesi ditemukan, memperoleh penghargaan pada skala nasional dan dibukukan pada 108 inovasi Indonesia tahun 2016. Selanjutnya, dua dari empat prototipe yang telah dihasilkan, saat ini sedang dalam tahap penjajakan untuk proses komersialisasi nya yaitu dengan Biofarma (kit untuk deteksi dini kanker serviks) dan PHAPROS (kit deteksi SNP HER-2 kanker payudara).

Disamping melakukan penelitian dan kerjasama riset, Lab BMKD juga menyediakan layanan pelatihan, pemeriksaan laboratoirum dan pembimbingan mahasiswa.

Visi:

Menjadi laboratorium yang memiliki kompetensi yang mumpuni dan mendukung kemandirian bangsa dalam hal  penyediaan  paket sistem deteksi dan  diagnostik

Misi:

1. Menguasai iptek di bidang bioteknologi agar menjadi penggerak utama dan acuan dalam meningkatkan kemajuan bangsa dan pembangunan berkelanjutan

2. Meningkatkan profesionalitas dan kompetensi anggota laboratorium pada bidang biologi molecular kesehatan dan diagnostik

3. Mempelajari dan menganalisa penanda penting penyakit degenerative dan infeksi sebagai sasaran diagnostic/deteksi (penanda untuk deteksi dini, monitoring, dan prediksi efektifitas obat)

4. Melakukan studi dan menyediakan paket system diagnostic yang mudah, dan ekonomis (material, formulasi dan   teknologi diagnostik) diaplikasikan pada manusia, hewan, tanaman dan mikroorganisme.

 

  • Studi epidemiologi
  • Studi penanda penyakit degeneratif dan infeksi sebagai sasaran diagnostik/deteksi (penanda untuk deteksi dini, monitoring, dan prediksi efektifitas obat)
  • Melakukan studi dan menyediakan paket sistem diagnostik yang mudah, dan ekonomis (material, formulasi dan   teknologi diagnostik) diaplikasikan pada manusia, hewan, tanaman dan mikroorganisme.
  • Penyediaan protein untuk aplikasi biosensor
  • Deteksi factor prediktif efektifitas pengobatan pada kanker payudara dan paru berbasis PCR
  • Deteksi dini kanker serviks
  • Deteksi halal haram berbasis PCR dan realtime PCR.
  1.  KTI nasional dan internasiona
  2. Prototipe kit deteksi serviks, SNP HER-2, PIK3CA H1047R dan mutasi gen EML4-AL
  3. Kontrol positif dan negatif kit deteksi SNP HER-2
  4. Data epidemiologi

Kompetisi invesi nasional Indonesia: 108 Inovasi Indonesia 2016

 Mengusulkan layanan sebagai berikut:

  • Uji halal/haram pada pangan olahan dengan teknik PCR (kualitatif) dan realtime PCR (kuantitatif)
  • Deteksi mikroba pengkontaminan pada makanan
  • Deteksi GMO pada produk pangan
  • Deteksi allergen
  • Identifikasi bakteri dan jamur dengan teknik PCR-seq.
  • Deteksi mutasi PIK3CA H1047R
  • Deteksi SNP HER-2
  • Deteksi translokasi gen EML4-ALK

 

  • Desriani, Wirsma Arif Harahap, Ariza Yandwiputra Besari. 2016. Improved PCR-RFLP Method for Her-2 Ile655Val Breast Cancer Patients Detection. International Journal on Advenced Science Engineering Information Technology. Vol. 6 No.2, 205-209.  DOI: 10.18517/ijaseit.6.2.742.
  • Desriani, Ramadhan, Wirsma Arief Harahap. 2013. Her-2/Neu Receptor Gene Isolation Study From Indonesian Breast Cancer Patients Tissue. Int J Pharm Bio Sci 4(1): p 179-183.

  • Bugi Ratno Budiarto, Desriani. 2016. Detection of HER2 Gene Polymorphism in Breast Cancer: PCR Optimization Study. Scientia Pharmaceutica. Volume 84: 103-111. doi:10.3797/scipharm.ISP.2015.03

  • Desriani, Bugi Ratno Budiarto, Wirsma Arif Harahap, et al. 2016. Data provision of PIK3CA gene diversity and recombinant plasmids preparation for control DNA in developing the trastuzumab predictive response diagnostic kit.  17:647-652.  Biodiversitas Journal. E-ISSN:  2085-4722. DOI:  10.13057/biodiv/d170227.

  • Budiarto,R.B., Harahap,W., Desriani. Development of SYBR GreenI-Based Melting Curve Method for HER2 I655V Polymorphism Detection in Breast Cancer. Makara J. Health Res., 2016, 20(2): 29-34 doi: 10.7454/msk.v20i2.5522

  • Desriani, Wirsma Arif Harahap,  Ida Yus Sriyani, Bugi Ratno Budiarto. 2016. PIK3CA Exon 20 Mutations in Breast Cancer of West Sumatera Province Patients of Indonesia. Hematol Oncol Stem Cell Theraphy. (submitted paper).

  • Desriani, Dwi Wulandari. 2015. PCR-RFLP Study of HER-2 Transmembrane Domain Genes. Proceedings of the 5th Annual Basic Science International Conference. 206-209. ISSN: 2338-0128. Volume 5.

  • Desriani, Lita Triratna. 2014. Isolation and Cloning of Partial HER -2 Gene from Indonesian Breast Cancer Pat ients for DNA Vaccine Development. Proceeding ASEAN COSAT 2014: Hal. 57-64. LIPI Press. ISBN 978-979-799-812-7

  • Desriani. 2014. Comparison Study of Three Different Polymerase Amplifying Breast Cancer HER-2 Gen For PCR-Based Diagnostic Applications Purpose. Proceeding The 3rd International Seminar on Chemistry Innovations and Advances in Chemistry for the 21st Century Challenges Jatinangor.Page: 161-163.  ISBN : 978-602-73435-0-4

  • Desriani, Azamris, Shabrina Syifa G.  2016. Design and Characterization of Tm Shift SYBR Green I qPCR Assay for HER-2 Ile655Val Detection in Breast Cancer. Egyptian Journal of Basic and Applied Sciences. (under review paper)

  • Desriani, Wirsma Arif Harahap, Bugi Ratno Budiarto, Ida Yusriyani. 2016. PIK3CA Exon 20 Mutations in Breast Cancer of West Sumatera Province Patients of Indonesia. Hematology/Oncology and Stem Cell Therapy (submitted paper)

  • Desriani, Bugi Ratno Budiarto, Farida Mirnawati, Wirsma Arif Harahap, Noza Hilbertina. . 2016. Cut off determination of HER-2 Scoring Status Based on qPCR Technique in frozen and Archival, Formalin Fixed, Paraffin Embedded (FFPE) Tissue of Breast Cancer. Biological Research Journal. (Accepted paper).

    •Budiarto, BR and Desriani. 2016. Dataset Reporting Detection of Breast Cancer-Related HER2I655VPolymorphism using Allele-Specific Polymerase Chain Reaction. Data in Brief. http://dx.doi.org/10.1016/j.dib.2016.09.033
  1. Paten terdaftar No. P00201100876 (Kit deteksi kanker serviks)
  2. Paten terdaftar No. P00201701284 (kit deteksi SNP HER-2)
  3. Paten terdaftar No. P00201008062 (nilai cut off penghitungan copy number HER-2)

 

PCR, real time PCR CFX96, spectrophotometer, dna elektrophoresis, protein elektrophoresis, refigerated centrifuge, dll

RUMAH SAKIT DHARMAIS, FKU Univ Andalas- RUMAH SAKIT M. DJAMIL PADANG,  RUMAH SAKIT PERSAHABATAN, KALBE FARMA, UI, IPB, UGM, UNSUD, ITS

BMKD
Henni Widyowati